El proyecto de  Transdipe comienza en Irun hacia el año 1992. Debido al cierre de las aduanas en  esos años, su fundador  que había dedicado la mayor parte de su vida a trabajar en estas instalaciones y que conocía ampliamente el sector del trasnporte en aquellos años , decidió comenzar esta empresa.

Habiendo pasado por distintos nombres y ubicaciones, hoy nos encontramos con la actual Transdipe S.L. fundada a finales del  año 2003, situada en el barrio de vemtas, cuidad froteriza con Francia y que la convierte en una ciudad con una ubicación privilegiada.